中医史学学科是我校一级学科中医学下的五个二级学科之一，并于1979年获得硕士学位授权，2013年获得博士学位授权。学科原由中医医学史、中医文献学、中医各家学说和医古文等学科综合组成，现在主要由中医医学史和中医文献学为主体组成，承担着本科生与研究生的教学与培养工作。学科于2012年被国家中医药管理局列为“十二五”重点学科“中医史学”建设学科，2018年建设期满后被评为合格等级，在全国同行业里具有重要一席之地。目前学科研究团队是由医史文献系、古汉语系以及图书馆古籍部骨干教师组成。
学科秉持立足于安徽地域新安医派流派、史学与文献学研究的特色和优势，积极拓展中医疾病史、中医古籍传播与交流史以及医学简帛治疗史等研究领域，取得了较为丰硕的研究成果，近些年获批科研项目32项，其中国家级3项，省部级16项。发表论文76篇，一类论文15篇，二类论文13篇，三类论文35篇。获科研奖励共7项。出版教材及著作18部，其中主编5人次，副主编6人次，编委26人次。获得省部级以上荣誉称号3人。大大凸显了学科特色，学科优势明显增强。
研究方向一：中医史学文献学研究。中医药形成与发展的史学与文献学研究，是本学科的主要研究方向。其是通过传统史学理念与方法，对中医药学科从形成到发展至今的脉络、事件、人物、学术思想与临证经验等的学科内史开展研究，并对与之对应和有关的社会、经济、政治、文化、商业等等外在的因素进行相关联的史学研究，从而揭示其中的规律，以期对现代中医药学的发展有所启发与借鉴。中医文献学的研究，是通过目录学、版本学、校勘学、辨伪辑佚等研究方法，对历史上医家学者编撰的医籍开展文献学研究，以期达到“辨章学术，考镜源流”的学术研究目的。
研究方向二：新安医学（史学、流派、文献学）研究。新安医学作为我省具有浓郁地方特色的中医学，一直是本学科研究的重点方向之一。通过传统的中医史学与文献学视角与方法，对新安医学的形成与发展的内在史学规律展开深入的系统的研究，与此同时，对与其相关的社会、经济、地理、文化、商业、物产、物候等等因素展开外史方面的研究，从而更加全面地揭示新安医学的发展规律。通过对新安医学发展史中形成的各学科学术流派的梳理工作，对其形成原因、发展脉络以及对中医药学学术思想和临床经验的丰富与贡献等展开系统的学术史研究。利用中医传统文献学理念与方法，对新安医家编撰的医药书籍，开展目录学、版本学、校勘学等的文献学研究，使之能为当今中医药的发展提供文献价值。
研究方向三：简帛医学史研究。对已经出土的与中医药等相关的简帛文献，利用考古学与语言学等理念与方法，开展其中的考证与研究，梳理出其在中医药发展过程的源头史学价值，为当今中医药的认识与发展提供根本依据。
