中医传染病学科是国家中医药管理局首批确定的“十一五”中医传染病临床基地和传染病重点研究室，2012年8月被确立为国家中医药管理局重点学科。学科经过20余年建设发展，在国内中医传染病领域具有重要影响力，目前发展为学校中医内科学、中西医结合学传染病研究方向硕士学位授予点，中医内科学博士学位授予点；同时为国家中医疫病防治基地、SFDA认定的中医肝病中药新药临床研究基地、安徽省中医感染性疾病医疗质量控制中心。学科担任多项国家级、省级学术单位副会长、主任委员及联盟理事单位，涵盖肝胆病、感染病、疑难病等多个专业领域，也是长三角中医肝病协作联盟合作单位，行业示范引领作用突出。学科目前拥有徐经世国医大师传承工作室、长三角王灵台名医工作室及多项安徽省名中医工作室等高水平中医人才培养与传承平台。目前学科形成五大核心特色研究方向，分别为中医药防治慢性乙型肝炎（临床治愈）、肝纤维化中医药防治与逆转、肝癌中西医协同诊疗、徐经世国医大师学术活态传承、新安医学疫病防治学术思想与实践研究，学科特色鲜明、优势突出。
在行业标准制定方面，学科牵头、执笔多项国家及省级权威诊疗方案、临床路径与指南，涵盖手足口病、艾滋病并发症、黄疸病、流感、基孔肯雅热等多种疫病，持续引领行业诊疗规范化发展。科研与人才建设成果丰硕，学科先后主持国家“十一五”至“十三五”科技重大专项分课题4项，承担国家、省级自然科学基金等各类科研项目40余项，获批各级中医药传承、人才培养项目10余项，累计科研经费近2000万元。斩获国家、省市级科技进步奖项多项，获评省级科技成果8项，授权专利6项；发表学术论文300余篇（SCI收录52篇），出版专著15部。同时创新5项中医理论、研发4种院内制剂，优化5类常见病种中医诊疗规范，系统总结国医大师7套临床诊疗方案，搭建2个专业数据库与推广网站并投入临床应用。主办全国性的学术会议12次，国家级继续教育项目10次，成为我国中医传染病学人才培养的重要基地。
研究方向一：中医药防治慢性乙型肝炎研究。本方向立足新安医学治肝特色与温病理论，聚焦慢性乙型肝炎核心病机与临床难点，围绕临床治愈、抗病毒、免疫调节、抗炎保肝、阻断肝纤维化开展系统研究。以临床疗效为核心，优化中西医结合诊疗方案，阐明中药复方作用靶点与信号通路，形成可复制、可推广的中医特色诊疗规范，打造国内领先的慢性肝炎中医药防治研究高地，为慢性肝病全程管理提供新安医学解决方案。
研究方向二：新发突发多发传染病中医药防治研究。本方向面向国家公共卫生安全需求，以流行性感冒、手足口病、发热伴血小板减少及未来可能面对的突发疫情等为重点，开展中医病因病机、证候规律、有效方药、防治方案和预警体系研究。凝练新安疫病论治经验，建立中医药应对突发公共卫生事件的快速响应机制，参与制定国家与行业诊疗标准，提升中医药在新发突发传染病防控中的核心作用与应急处置能力。
研究方向三：肝纤维化中医诊治与抗肝纤维化研究。本方向围绕肝纤维化“气虚血瘀、痰湿内蕴”核心病机，以“疏肝健脾、益气活血、软坚散结”为治法，开展中医证候规律、疗效评价与作用机制研究。研发特色方药与院内制剂，建立无创诊断与中医干预一体化模式，推动中医药在逆转肝纤维化、阻断肝硬化进展方面的优势转化，形成国内有影响力的肝纤维化中医防治研究方向。
研究方向四：国医大师徐经世学术思想活态传承研究。本方向以国医大师徐经世临床经验与学术思想为核心，开展临证经验整理、理论挖掘、方药配伍规律、传承模式创新研究。构建名老中医经验传承数据库与知识库，开发特色诊疗技术与方案，推动名家经验向临床规范、教材内容与科普成果转化，打造新安医学名家传承创新示范平台，为中医师承教育与学术传承提供样板。
